نشریه علمی- پژوهشی "پژوهش ­های کاربردی در گیاه­پزشکی" مقاله های تحقیقی و اصیل در تمامی زمینه های علوم گیاهپزشکی و موضوعات مرتبط با آن را در قالب مقاله  کامل پژوهشی، مقاله کوتاه، گزارش علمی کوتاه  پذیرش و چاپ می کند.

محورهای اصلی پذیرش مقاله: 

• مدیریت بیماری های گیاهی
• مدیریت آفات گیاهی
• مدیریت علف های هرز (با تاکید بر کنترل شیمیایی و زیستی)
• حفاظت گیاهان
• تشخیص عوامل بیماری زای گیاهی (قارچ ها، پروکاریوت ها، ویروس ها، نماتودها، گیاهان عالی انگل و ...).
• کنترل زیستی عوامل بیماری زا گیاهی، آفات گیاهی و علف های هرز

• مدیریت تلفیقی آفات (شامل مهره‌داران، بی‌مهرگان، میکروارگانیسم‌ها و علف‌های هرز)

• زیست‌شناسی، رفتارشناسی، ژنتیک، بیوشیمی، سیستماتیک، فیزیولژی و اکولژی آفات و عوامل مفید
• عوامل تنش‌زای غیرزنده در گیاه‌پزشکی

• تنوع زیستی و برهم‌کنش‌ها در گیاه‌پزشکی

• روابط متقابل گیاهان، آفات و دشمنان طبیعی

• کنترل بیولژیک و میکروبیولژیک، امنیت غذایی و گیاه‌پزشکی

• فناوری‌های نوین در مدیریت آفات

• کاربرد آفت­کش‌ها و اثرات زیست محیطی آنها

• گیاه‌پزشکی و کشاورزی پایدار

• اثرات اقتصادی و اجتماعی مدیریت آفات

• گیاه‌پزشکی و کشاورزی دقیق