شناسایی گونه ‎های Trichoderma از مناطق جنگلی شهرستان خرم ‎آباد با استفاده از ویژگی ‎های ریخت‎ شناختی و مولکولی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‎آباد، ایران.

2 روه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‎ آباد، ایران.

3 گروه گیاه‎پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا همدان، همدان، ایران.

چکیده

گونه‎ های جنس Trichoderma از فراوان‎ ترین قارچ‎ های خاکزی جهان می‌باشند. این قارچ‎ ها در گستره ‎ایی از مناطق آب و هوایی گوناگون حضور دارند. در حالی‎ که برخی از گونه ‎ها همه‎ جا‎زی هستند، برخی نیز محدود به مناطق جغرافیایی خاص می‎ باشند. بیشتر اعضای این جنس به عنوان عوامل کنترل زیستی بالقوه بیماری‎ های گیاهی و محرک رشد گیاهان ارزیابی شده ‎اند. این مطالعه با هدف شناسایی گونه‎ های Trichoderma از مناطق جنگلی شهرستان خرم ‎آباد انجام شد. برای این منظور در سال‎ های 1399-1398 نمونه‎ های خاک از مناطق جغرافیایی مختلف شهرستان خرم‎ آباد جمع ‎آوری شد. پس از جداسازی و خالص ‎سازی و غربال جدایه ‎ها براساس ویژگی‎ های ریخت ‎شناختی، جدایه ‎های متفاوت برای مطالعات مولکولی انتخاب شدند. در مجموع 200 جدایه متعلق به سه بخش به نام‎ های Trichoderma، Pachybasium و Longibrachiatum شامل هشت گونه‎ به نام ‎های T. atroviride،T. brevicompactum ،T. citrinoviride، T. longibrachiatum، T. virens، T. viridescens، Trichoderma sp. 1 و Trichoderma sp. 2 براساس ویژگی‎ های ریخت ‎سنجی، ریخت‎ شناختی و واکاوی تبارزایی ناحیه ITS و ژن tef1-α شناسایی شدند. نتایج نشان داد که دو جدایه Trichoderma sp. 1 متعلق به بخش Trichoderma و Trichoderma sp. 2 متعلق به بخش Longibrachiatum از نظر ویژگی‎ های میکرومورفولوژیکی با هیچ کدام از گونه‎ های Trichoderma توصیف شده شباهت نداشتند، و به عنوان کاندیدای گونه جدید برای قارچ ‎های دنیا مطرح می ‎باشند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Identification of Trichoderma species from forest regions of Khorramabad County using morphological and molecular characteristics

نویسندگان [English]

  • Zahra Mirzaeipour 1
  • Eidi Bazgir 2
  • Doustmorad Zafari 3
  • Mostafa Darvishnia 1
1 Department of Plant Protection, Agriculture Faculty, Lorestan University, Khorramabad, Iran.
2 Department of Plant Protection, Agriculture Faculty, Lorestan University, Khorramabad, Iran.
3 Department of Plant Protection, Agriculture Faculty, Hamedan Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran.
چکیده [English]

Trichoderma species are among the most abundant soil-inhabiting fungi with global distribution, occuring in wide range of climates. While most species are cosmopolitan, some species are restricted to certain geographical regions. Members of this genus have been evaluated as a potential plant disease biocontrol agents (BCA) and plant growth promoters. This study was conducted for the identification of Trichoderma species from the forest areas of the Khorramabad County, Iran. Soil samples were collected from different geographical areas in the Khorramabad County during different seasons of 2019-2020. After isolation and purification as well as screening of isolates based on morphological characteristics, isolates with different morphological characteristics were selected for molecular studies. A total of 200 isolates belonging to three sections namely Trichoderma, Pachybasium and Longibrachiatum including eight species namely, T. atroviride, T. brevicompactum, T. citrinoviride, T. longibrachiatum, T. virens, T. viridescens, Trichoderma sp. 1 and Trichoderma sp. 2 were identified based on their morphology and phylogenetic analysis of ITS region and tef1-a gene. The results showed the that two isolates namely Trichoderma sp. 1 of Trichoderma section and Trichoderma sp. 2 of Longibrachiatum section were not similar to any of the described Trichoderma species in terms of micromorphological characteristics, thus representing candidates for novel Trichoderma species.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Biodiversity
  • Phylogeny
  • ITS
  • tef1-a
  • Taxonomy