Identification and Detection of Potato Virus Y Strains Using TAS-ELISA and RT-PCR from Pepper Fields in Golestan Province

Document Type : Research Paper

Authors

1 MSc Student, Dept. of Plant Pathology Faculty of Plant Production, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources .

2 2Associate Professor, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources.

3 Ph.D. Student, Dept. of Plant Pathology, Zabol University.


انصاری دزفولی آ، معصومی ح و هاشمی ه، 1392. انتقال و بیان ژن­های پروتئین پوششی ویروس­های Y نژاد نکروتیک (PVYN) و ویروس S سیب­زمینی در سیب­زمینی رقم آگریا (Solanum tubersum var Agria). فناوری زیستی در کشاورزی، جلد 12.صفحه­های 35 تا 45.
ایزد پناه ک، اشکان م، بنی هاشمی ض، رحیمیان ح و میناسیان و، 1389. بیماری شناسی گیاهی (اگریوس، جرج ان).آییژ.
باسره س، پوررحیم ر، ملکی م و فرزادفر ش، 1391. گزارش آلودگی ویروس وای سیب­زمینی در مزارع فلفل استان گلستان. صفحه 843، خلاصه مقالات بیستمین کنگره گیاهپزشکی ایران، شیراز.
پوررحیم ر و فرزادفر ش، 1391.ردیابی آلودگی ویروس وای­سیب­زمینی در گیاه Capsicum annuum با استفاده از واکنش زنجیره­ای­پلیمراز. صفحه 146، دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران، تهران.
پورشریفی پ، دیزجی ا و کوهی­حبیبی م، 1391. بررسی تفاوت­های بیولوژیکی و ژنتیکی جدایه­های مختلف میزبانی ویروس وای سیب­زمینی. صفحه 824، خلاصه مقالات بیستمین کنگره گیاهپزشکی ایران، شیراز.
قاسم­زاده آ، سخندان­بشیر ن و خاک­ور ر، 1391. ردیابی مولکولی ویروس وای­سیب­زمینی با استفاده از آغازگر­های عمومی در استان اردبیل.  نشریه دانش کشاورزی و تولید پایدار، جلد22، شماره2.صفحه­های 67 تا 78.
حسینی ع، معصومی ح، حسینی­پور ا، حیدرنژاد ج و شعبانیان م، 1385. شناسایی و تمایز نژادهای N، C ، NTNو O ویروس وای­سیب­زمینی (PVY) با استفاده از روش­های سرولوژی و مولکولی. صفحه 230، خلاصه مقالات هفدهمین کنگره گیاهپزشکی ایران، تهران.
راستگو م و طوسی ن، 1391. تعیین میزبانان طبیعی ویروس وای سیب­زمینی در منطقه ارومیه و تعیین خصوصیات مولکولی جدایه توتون. صفحه 868، خلاصه مقالات بیستمین کنگره گیاهپزشکی ایران، شیراز.
زینتی فخر­آباد ف، نصرالله­ نژاد س، احمدی­خواه ا و تقی­نسب م، 1389. ردیابی ویروس وای سیب­زمینی با استفاده از روش­های سرولوژیکی و گیاهان محک در مزارع توتون استان گلستان. صفحه 28، پنجمین همایش ملی ایده­های نو در کشاورزی،اصفهان.
زینتی فخر­آباد ف، نصرالله­ نژاد س، احمدی­خواه ا و تقی­نسب م، 1391. فراوانی و تعیین ترادف سه جدایه ویروس وای سیب­زمینی از مزارع توتون و مقایسه فیلوژنتیکی با سایر جدایه­های دنیا. بیماری­های گیاهی، جلد 48، شماره 3. صفحه­های 417 تا 421.
مجدآبادی فراهانی س،جعفرپورب، فلاحتی رستگارم وسبک خیز م ع، 1389. ردیابیوشناسایینژاد PVYNTNدر مزارعسیب زمینیاستانخراسانرضوی.نشریهحفاظتعلومگیاهی،جلد24. صفحه های385تا390.
معرف­زاده ن، خاطری ه، کوهی­حبیبی م، مصاحبی­محمدی غ ح، حمزه ن، غضنفری ک و حسینی ع، 1385. وضعیت آلودگی ارقام تجاری توتون به ویروس وای سیب­زمینی و شناسایی سویه نکروتیک ویروس در مزارع توتون استان­های مازندران و گلستان. صفحه 225، خلاصه مقالات هفدهمین کنگره گیاهپزشکی ایران، تهران.
کریمی، ع ر، 1345. بیماری­های ویروسی سیب­زمینی در ایران. نشریه­ی بیماری­های گیاهی، جلد 3، شماره 2. صفحه­های 23 تا 32.
Boukhris S, Khamassy N, Glais L and Kerlan C, 2007. Occurrence in Tunisia of potato tuber  necrotic ringspot disease (PTNRD) caused by variant  PVYNTN  of potato virus Y. New Disease Reports 15(5).
Brunt AA, 2001.Potyviruses. Pp. 77-86 In: Loebenstein G, Berger PHB, runt AA and Lawson RH,
(eds) Virus and virus-like diseases of potatoes and production of seed-potatoes. KluwerAcademic Publishers.
Converse RH and Martin RR, 1990. ELISA methods for plant viruses.Academic Press.
Cuevas JM, Delaunay A, Rupar M, Jacquot E and Santiago FE, 2012.Molecular evolution and phylogeography of potato virus Y based on the CP gene. Journal of General Virology 93: 2496–2501.
Daquino L, Dalmay T and Burgyan, J, 1995. Host range and sequence analysis of isolate of potato virus Y inducing veinal  necrosis in pepper. Plant Disease 79(10): 1046-1050. 
De Bokx JA and Huttinga H, 1981.potatovirus Y. Descriptions of plant viruses, No. 242.Commonw Mycol Inst/Assoc Appl Biol, Kew, England.
Fanigliulo A, Comes S, Pacella R, Harrach B, Martin DP and Crescenzi A, 2005. Characterisation of potato virus Y nnp strain indusing veinal necrosis in pepper, naturally ovvuring recombinant strain of PVY. Archives of virology 150(4): 709-720.
Gholami S, Koohi habibi  M, Boushehri AA and Naghavi MR, 2007. Detection of potato virus Y byreverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Iranian Journal of AgriculturalSciences 38: 399-405.
Hosseini A, Massumi H, Heydarnejad J, Hosseini Pour A and Varsani A, 2011. Characterisation of potato virus Y isolates from Iran. Virus Genes 42: 128-140.
Ibaba JD and Gubba A, 2011. Diversity of potato virus Y infection solanaceous vegetables in the province of Kwazula- natal in the Republic of south Africa. Crop Protection  30: 1404-1408.
Liave C, Martinz B, Dıaz-Ruız, JR and Lopez-Abella D, 1999. Serological analysis and coat protein sequence determination of potato virus Y (PVY) pepper pathotypes and differentiation from other PVY strains. European Journal of Plant Pathology  105847–857
Lorenzen JH, Piche LM, Gudmestad NC, Meacham T and Shiel P, 2006. A multiplex PCR assay to characterize potato virus Y isolates and identify strain mixtures. Plant Disease 90: 935-94.
Lorenzen, J, Nolte P, Martin D, Pasch, JS and Gudmestad NC. 2008. NE-11 represents a new strain variant class of potato virus Y. Archives of Virology 153: 517-525.
Mahy BWJ and Van-Regenmorted MHV, 2008.Encylopedia of Virology.Academic Press.
Moodley  V, Ibaba  JD, Naidoo R and Gubba A, 2014. Full-genome analyses of a potato virus Y (PVY) isolate infecting pepper (Capsicum annuum L.) in the Republic of South Africa. Virus Genes 49(3): 466-76.
Moravec T, Cerovska N and Boonham N, 2003. The detection of recombinant, tuber necrosing isolates of potato virus Y (PVYNTN) using a three-primer PCR based in the coat protein gene. Journal of Virological Methods 109:63-68.
Marei-Jeanne V, Loos R, Peyre J, Alliot B and Signoret P, 2000.Differentiation of poaceae potyviruses by reverse transcription-polymerase chain reaction and analysis. Journal of Phytopathology 148: 141-151.
Mostafae S, Mosahebi,G, Koohi Habibi M and Ansari Desfouli E, 2008. Study of biological and molecular characterization of pepper-PVY isolated from pepper field and it’s compersion with other PVY isolates. Iranian Journal of Virology 2: 31-34.
Mostafae S, Mosahebi G and Kuhi Habibi, M., 2012. The first report of PVY incidence in Iran pepper fields. Global Advanced Research Journal of Microbiology 2: 013-018.
Nie X and Singh RP, 2002.A new approach for the simultaneous differentiation of biological and geographical strains of potato virus Y by uniplex and multiplex RT-PCR. Journal of Virological Methods 104: 45-54.
Riechmann JL, Lain S and Garcia JA, 1992.Highlights andprospects of potyvirus molecular biology. Journal Genes Virological 73: 1–16.
Rigotti S and Gugerli P, 2007. Rapid identification of potato virus Y strains by one –step triplex RT-PCR.Journal of Virological Methods 140: 90-94.
Rolland M, Glais L, Kerlan C and Jacquot E, 2008.A multiple single nucleotide polymorphisminterrogation assay for reliable potato virus Y group variant characterization. Journal of VirologicalMethods147: 108-117.
Sadeghi MS, Behjatnia SAA, Masumi  M, and Izadpanah  K,  2008. Characterisation of a strain of potato virus Y causing eggplant mosaic in southern Iran. Australasian Plant Pathology 37(1): 79–86.
Schubert  J, Fomitcheva V and Wisniewska JS, 2007. Differentiation of potato virus Y strains using improved sets of diagnostic PCR-primers. Journal of Virological Methods 140: 66-74.
Smith P, 1931.  Potato virus Y. Description of viruses No: 242. CMI/AAB.
Szemes MM, Klerks J, Heuvel V and Schoen CD, 2002. Development of a multiplex amplidet RNA assay for simultaneous detection and typing of potato virus Y isolates. Jornal of Virological Methods 100: 83-96.
Tribodet M, Glais  L, Kerlan C and  Jacqot E, 2005. Characterization of potato virus Y (PVY) molecular determinants involved in the vein necrosis symptom induced by PVYN  isolates in infected Nicotiana tabacum cv.Xanthi. Journal of General Virology 86: 2101-2105.
Xianzhou N and Maturesh S, 2013. Response of potato, tabacco and  Physalis floridana plants to mixed infection with PVY, PVYNTN and PVYO strains.  Journal Plant Pathology 35(3): 390-401.
Zinati fakhrabad F, AhmadikhahA and Nasrollahnejad S, 2012.Identification and detection of Potato virus Y strains by molecular methods in tobacco fields of North Iran. International Research Journal of Applied and Basic Sciences 3: 1422-1428.