دانشگاه تبریز پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی 2383-1855 1 1 2012 11 21 Molecular Identification and Phylogenetic Analysis of Cucumber Mosaic Virus IB Subgroup from Althaea officinalis شناسایی مولکولی و تجزیه¬تحلیل تبارزایی ویروس موزاییک خیار زیرگروه IB جداشده از گیاه دارویی ختمی 29 40 149 FA داود کولیوند دانشجوی دوره دکتری بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه تبریز نعمت سخندان بشیر دانشیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه تبریز سویل نعمت الهی استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه آزاداسلامی واحدتبریز Journal Article 2012 08 13 Cucumber mosaic virus (CMV) belongs to the genus Cucumovirus in the family Bromoviridae. Althaea officinalis, commonly known as hollyhocks in the family Malvaceae, is an annual plant whose fruit, flower and root are used as medicinal products. In this study, five samples of hollyhocks leaves with viral symptoms were collected and CMV was detected using DAS-ELISA from the samples. Ta-alth isolate was selected and total RNA extracted. The PCR reaction was performed using CMV-CPF and CMV-CPR primer pair corresponding to the CP region of CMV and as a result, a 675 bp band was amplified. The amplified fragment inserted into pTZ57R/T and transformed into competent cells of E. coli strain DH5α. Extracted recombinant plasmid was analyzed by restriction analysis then sequencing. The GeneDoc was used to compare the generated CP sequence with the counterpart segment of previously reported CMV isolates from Iran and other parts of the world available in GenBank. A phylogenetic tree was generated with Neighbor-Joining (NJ) method in TREECON program which showed that the Ta-alth isolate belonged to subgroup IB of CMV. This is the first report of CMV from Althaea officinalis in Iran. ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus (CMV) ، از جنس Cucumovirus و خانواده Bromoviridae میباشد. خَتمی (Althaea officinalis) گیاهی یکساله و خودرو از تیره پنیرکیان است که گل، میوه و ریشه آن مصارف دارویی دارد. در این تحقیق، پنج نمونه مشکوک به آلودگی با CMV از گیاه ختمی جمعآوری و وجود CMV با آزمونهای سرولوژیکی از جمله DAS-ELISA ، از نمونهها ردیابی شد. از بین آنها، جدایه Ta-alth انتخاب و پس از استخراج RNA کل از گیاه آلوده به آن، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه ژن پروتئین پوششی، RT-PCR انجام و قطعه 675 جفت بازی تکثیر شد. قطعه تکثیر شده درون پلاسمید pTZ57R/T همسانهسازی و سپس تبدیل سلولهای مستعد Escherichia coli سویه DH5α انجام گردید. جهت حصول اطمینان از قرارگرفتن قطعه موردنظر درون حامل، تجزیهتحلیل پلاسمید نوترکیب خالصسازیشده با استفاده از آنزیمهای برشی انجام و توالی قطعه تکثیری تعیین گردید. توالی بهدستآمده با استفاده از برنامه GeneDoc با توالیهای متناظر سایر جدایههای CMV از ایران و نقاط دیگر دنیا (موجود در بانک ژن) مقایسه و درخت تبارزایی با استفاده از روش Neighbor-Joining(NJ) و برنامه TREECON رسم گردید. تجزیهتحلیل ترادف ژن پروتئین پوششی جدایهTa-alth نشان داد که این جدایه متعلق به زیرگروه IB ویروس موزاییک خیار میباشد. این اولین گزارش از آلودگی ختمی به CMV در ایران است. https://arpp.tabrizu.ac.ir/article_149_fd3d66e63fa5f1f2e8d7f64b69a53b65.pdf