دانشگاه تبریز پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی 2383-1855 11 1 2022 03 21 Antagonistic potential of epiphytic bacteria associated with pome fruit trees in West Azarbaijan province against Erwinia amylovora and evaluation of their genetic diversity بررسی پتانسیل آنتاگونیستی باکتری‌های اپی‌فیت همراه با درختان میوه دانه‌دار در استان آذربایجان غربی بر علیه Erwinia amylovora و ارزیابی تنوع ژنتیکی آنها 109 120 13500 10.22034/arpp.2021.13500 FA حبیب نوجوان چیچکلوی منصور بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. عباسعلی روانلو بخش تحقیقات بیماریهای گیاهان، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران. سعید طریقی بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. Journal Article 2021 09 06 <strong>Abstract</strong><br />There are many epiphytic bacteria live on surface of pome fruit tree foliage, and have been proven to show antagonistic activity against <em>Erwinia amylovora</em>, the causal agent of fire blight disease. In order to characterize and assess antagonistic potential and genetic diversity of epiphytic bacteria associated with pome fruit trees in orchards of West Azarbaijan province samplings were carried out from foliage of apple, pear, and quince trees during spring, summer and autumn in 2014. Epiphytic bacteria were isolated and their antagonistic potential against <em>E. amylovora</em> were evaluated and then bacterial isolates were identified. The isolated bacteria were categorized into three group including <em>Pantoea</em> <em>agglomerans</em>, <em>Pseudomonas</em> <em>fluorescens </em>and other unknown Gram-positive bacteria. Genetic diversity among the Pseudomonas and Pantoea isolates were studied using Rep-PCR technique. Resulted data were analyzed in NTSYSpc v2.02e software and compared using UPGMA and Jaccard similarity coefficient methods. Also, the analyses of the BoxA1R primer’s band patterns separated ten groups with at least 75% similarity among the pseudomonad isolates. Similarly, nine groups with 70% similarity within the <em>Pantoea</em> isolates were discovered. These results showed a high genetic diversity among the epiphytic strains of <em>Pseudomonas</em> and <em>Pantoea</em> in west Azarbaijan pome fruit orchards.<br />  <strong>چکیده</strong><br />در شاخ و برگ­های درختان میوه دانه ­دار، باکتری­های اپی­فیت زیادی وجود دارند که خاصیت آنتاگونیستی آنها علیه عامل بیماری آتشک (<em>Erwinia amylovora</em><em>)</em> اثبات شده است. به منظور شناسایی، بررسی پتانسیل آنتاگونیستی و تنوع ژنتیکی باکتری­های اپی­فیت آنتاگونیستی همراه با درختان میوه­ دانه دار در استان آذربایجان غربی، از باغات سیب، گلابی و به در سه نوبت بهار، تابستان و پاییز سال 1393 نمونه­برداری به عمل آمد. پس از جداسازی باکتری­های اپی­فیت و انجام آزمون آنتاگونیستی، شناسایی جدایه­ها صورت گرفت. جدایه ­ها در دو گروه باکتری­های گرم منفی (<em>Pantoea agglomerans</em>، <em>Pseudomonas fluorescens</em>) و گرم مثبت دسته ­بندی شدند. تنوع ژنوتیپی جدایه­ های <em>Pantoea </em><em> </em>و <em>Pseudomonas</em> از مناطق مختلف با استفاده از روش Rep-PCR مورد بررسی قرار گرفت. جدایه ­ها با استفاده از برنامه­  نرم ­افزاری NTYsys به روش UPGMA و ضریب تشابه جاکارد مورد بررسی قرار گرفتند. تجزیه و تحلیل اطلاعات بدست آمده بر اساس نشانگر BOX1 نشان دهنده وجود 10 گروه با حداقل شباهت 75 درصد در میان جدایه ­های Pseudomonas و وجود 9 گروه در میان جدایه­ های <em>Pantoea </em><em> </em>با حداقل شباهت 70 درصد بود. نتایج تنوع ژنتیکی بالایی را در میان سویه­ های آنتاگونیست اپی­فیت درختان میوه دانه­ دار در استان آذربایجان غربی نشان داد.<br />  https://arpp.tabrizu.ac.ir/article_13500_7a1308446a9f811c0ebb45f693ebd0db.pdf