دانشگاه تبریز پژوهش های کاربردی در گیاهپزشکی 2383-1855 10 1 2021 03 21 Identification of Fusarium species associated with root rot symptoms of the rapeseed in Khuzestan province شناسایی گونه ‏های Fusarium همراه علایم پوسیدگی ریشه کلزا در استان خوزستان 29 43 12465 10.22034/arpp.2021.12465 FA عذرا نعمتی مندنی پور گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران. رضا فرخی نژاد گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران. مهدی مهرابی کوشکی گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران. مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی و علوم زیستی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران Journal Article 2021 02 15 <strong>Abstract</strong> <br />Rapeseed is a host for a large number of pathogenic and non-pathogenic fungi, including <em>Fusarium</em>. During 2018–2020, 40 rapeseed samples showing yellowing, wilting and root rot were collected from different areas in Khuzestan province, which led to the isolation of 35 <em>Fusarium</em> isolates on potato-dextrose-agar (PDA). Ten isolates were selected based on the shape of the colonies and conidia and identified according to phylogenetic analysis and morphology. For molecular study, two regions including the internal transcribed spacer nuclear ribosomal DNA region (ITS) and translation elongation factor 1-α gene (<em>TEF1</em>) were amplified and sequenced. These sequences were analyzed by phylogenetic analysis using maximum likelihood and Bayesian inference algorithms. Accordingly, <em>F. acuminatum</em>, <em>F. clavum</em>, <em>F. gracilipes</em>, <em>F. incarnatum</em> and <em>F. tanahbumbuense</em>,and a representative species of the new lineage were identified. To our knowledge, this is the first report of the species <em>Fusarium acuminatum, </em><em>F. clavum</em>, <em>F. gracilipes</em>, <em>F. incarnatum</em> and <em>F. tanahbumbuense</em> on rapeseed in Iran. Moreover, the species <em>F. gracilipes</em>is a new record for the Mycobiota of Iran. <strong>چکیده</strong><br />گیاه کلزا میزبان تعداد زیادی عوامل قارچی بیماری‏زا و غیر‏بیماریزا از جمله گونه های جنس <em>Fusarium</em> است. در طول سال های ۹۸-۹۶، 40 نمونه گیاهی کلزا با علایم زردی، پژمردگی و پوسیدگی ریشه در استان خوزستان جمع‌آوری گردید، از این نمونه‏ ها، 35 جدایه <em>Fusarium</em> روی محیط کشت سیب ‏زمینی دکستروز-آگار (PDA) بدست آمد. ده جدایه از آن­ها بر اساس شکل پرگنه و کنیدیوم‏ ها انتخاب و بر اساس تجزیه‏ و ‏تحلیل تبارزایی و ریخت ‏شناسی شناسایی شدند. برای بررسی مولکولی، دو ناحیه ITS دی­ ان ­ای ریبوزومی (ITS) و ژن کد کننده فاکتور تداوم ترجمه (<em>tef1</em>) توالی‏ یابی و در جستجوی بلاست و تجزیه ‏و ‏تحلیل تبارزایی با استفاده از الگوریتم درست‏ نمایی بیشینه و استنباط بیژین استفاده شدند. بر اساس تلفیق داده های ریخت شناختی  و داده های مولکولی، در این تحقیق گونه های  <em>Fusarium acuminatum</em>، <em>F. clavum</em>، <em>F. gracilipes</em>، <em>F. incarnatum</em> و <em>F. tanahbumbuense</em> و یک گونه نماینده دودمان جدید شناسایی شدند. بر اساس دانش ما، این اولین گزارش گونه ‏ها­ی <em>F. acuminatum</em>، <em>F. clavum</em>، <em>F. gracilipes</em>، <em>F. incarnatum</em> و <em>F. tanahbumbuense</em> روی کلزا در ایران است. همچنین گونه‏ <em>F. gracilipes</em> برای میکوبیوتای ایران جدید است. https://arpp.tabrizu.ac.ir/article_12465_5aa241e1aae7c9a66172b6bd158cd223.pdf